商城小程序和微商城在功能和使用上有一些区别。

1. 平台限制：微商城是基于微信公众号的功能扩展，只能在微信平台上运行。而商城小程序可以在多个平台上运行，例如微信、支付宝、百度等。

2. 用户体验：商城小程序相对于微商城更加灵活和自由，可以提供更多个性化的用户体验。商城小程序可以定制化开发，提供更多的功能和交互体验。

3. 需要下载：微商城只需通过微信公众号进入即可使用，用户不需要下载额外的应用程序。商城小程序需要用户主动下载安装，但下载后可以直接打开使用，无需再次登录。

4. 开发成本：商城小程序的开发成本相对较高，需要独立开发或委托开发团队进行开发。而微商城是基于微信公众号的功能扩展，可以通过微信公众号后台自行搭建。

5. 营销功能：商城小程序可以更加灵活地进行用户营销，例如通过社交分享、用户积分、优惠券等方式来增加用户粘性和活跃度。微商城相对来说可选择的营销功能较少。

总的来说，商城小程序相对于微商城在功能和用户体验上更加强大和灵活，但需要较高的开发成本。微商城则更适合初创企业或个人快速搭建一套简单的电商平台。具体选择要根据具体需求和实际情况来决定。